Τα φίλτρα ενεργού άνθρακα είναι δυνατόν να αποτελέσουν εστία μόλυνσης. Για το λόγο αυτό συνιστάται το νερό να μη μένει στάσιμο στο φίλτρο για περισσότερες από μερικές ώρες. Σε αντίθετη περίπτωση συνιστάται να αφήνουμε τη βρύση να τρέξει για 1-2 λίτρα πριν πάρουμε νερό προς πόση και χρήση.